Mae Astaxanthin yn pigiad coch sy'n bodoli mewn llawer o organebau naturiol.Astaxanthin naturioli'w weld yn bennaf mewn organebau morol sy'n wahanol i gloroffyl a β-caroten mewn planhigion daearol. Mae'n fath o ficroalgae sy'n cael ei ddefnyddio gan lawer o wahanol fathau o organebau dyfrol. Mae colomennod coch cryf Astaxanthin yn achosi i'r anifeiliaid hyn gael cnawd neu silffoedd coch neu binc.
Eog coch a geir yn y Cefnfor Tawel gwyllt yw un o'r crynodiadau uchaf oastaxanthin naturiol, ac eithrio H. Pluvialis. Mae'r pigment hwn yn rhoi eiddo gwrthocsidiol coch dwfn ac anhygoel o iach i gig y pysgodyn. Ymhlith y ffynonellau naturiol eraill o astaxanthin mae cimychiaid, llwyni Arctig, cranc, cimychiaid, brithyll coch, algâu a krill. Mae adar coch fel arfer yn cael eu lliw drwy fwyta pysgod a phlanhigion sy'n gyfoethog mewnastaxanthin, ond mae eu crynodiadau pigment fel arfer yn isel.
Er mai bywyd morol yw'r ffynhonnell fwyaf cyffredin oastaxanthin naturiol, nid yw wedi'i gyfyngu i blanhigion ac anifeiliaid sy'n seiliedig ar ddŵr. Er enghraifft, mae burum o'r enw Xanthophyllomyces dendrorhous (Phaffia ydwyrain) hefyd yn cynnwys lefelau cymharol uchel o astaxanthin. Mae'n gynhyrchydd astaxanthin. Ni fydd yn ei amsugno o ffynonellau organig eraill.
